Dua pertiga dari anak-anak yang menjalani tes genetik di unit perawatan intensif anak menunjukkan varian genetik, dan sepertiga dari anak-anak ini menerima perubahan perawatan sebagai hasilnya, menurut sebuah studi baru yang dipresentasikan di Society of Critical Care Medicine’s (SCCM) 2023 Kongres Perawatan Kritis.
“Kami telah banyak berhasil menggunakan pengurutan genom untuk membantu tidak hanya dengan diagnosis, tetapi juga perubahan dalam manajemen,” penulis utama Katherine Rodriguez, MD, seorang dokter perawatan kritis pediatrik di Rady Children’s Hospital, San Diego, California, mengatakan kepada Medscape Berita Medis.
Namun, data penggunaan rapid whole genome sequencing (rWGS) di unit perawatan intensif anak (PICU) terbatas, dan data dari berbagai institusi masih kurang, kata Rodriguez. Dalam studi saat ini, data dari beberapa rumah sakit memungkinkan para peneliti untuk memeriksa perbedaan manajemen antar institusi, katanya.
Rodriguez, dengan peneliti utama Nicole Coufal, MD, juga dari Rady Children’s, dan rekan melakukan penelitian di tiga rumah sakit anak dari Maret 2019 hingga Juli 2022. Populasi penelitian mencakup 80 anak yang asal penyakitnya tidak pasti. Para pasien menjalani pengujian rWGS di PICU atau pengaturan ICU jantung. Para pasien berkisar dari 0 sampai 17 tahun; 64% lebih muda dari 1 tahun, (usia rata-rata, 2,8 tahun); 56% adalah laki-laki, dan 59% berkulit putih.
Setelah pengujian rWGS, 65% anak positif untuk varian genetik. Data mendorong perubahan untuk merawat 42% dari pasien ini; 38% perubahan terjadi selama pasien tinggal di PICU, termasuk perubahan pengobatan dan prosedur yang dihindari atau diselesaikan.
Sisa 62% dari perubahan tersebut adalah manajemen subakut dan terpengaruh untuk sisa rawat inap anak dan setelah keluar, Rodriguez menjelaskan dalam presentasinya.
Waktu penyelesaian rata-rata untuk pengujian adalah 10 hari, yang penting bagi seorang intensifivis, yang mungkin ragu untuk memesan tes karena waktu yang terlibat, kata Rodriguez. Studi saat ini menunjukkan bahwa “kita bisa mendapatkan hasil tes dalam waktu yang wajar untuk membuat perubahan yang berarti dalam perawatan,” katanya kepada Medscape.
Memilih pasien mana yang akan diuji dapat menjadi tantangan bagi dokter, aku Rodriguez. “Kami telah mengetahui pasien mana yang cenderung memiliki genom diagnostik atau tidak diagnostik, tetapi itu juga firasat,” katanya.
“Jika anak ini adalah pasien Anda dan Anda khawatir, jika mereka tampak lebih sakit dari yang diperkirakan, atau memiliki riwayat keluarga yang memprihatinkan, kirimkan tesnya,” katanya. “Ini menjadi lebih terjangkau, dan dapat kembali dengan cukup cepat untuk memandu pengobatan saat pasien masih di ICU.”
Dalam studi saat ini, utilitas diagnostik terbesar muncul pada pasien dengan gejala jantung, seperti penyakit jantung bawaan, serangan jantung mendadak, atau dugaan channelopathy, kata Rodriguez dalam presentasinya.
Pasien dengan dugaan penyakit neurologis memiliki tingkat diagnosis molekuler 50%. “Menariknya, 74% pasien dengan penyakit pernapasan di mana etiologi genetik yang mendasari diduga menerima diagnosis molekuler,” meskipun rWGS tidak diterapkan pada populasi umum dengan RSV atau penyakit pernapasan lainnya, katanya.
Dalam presentasinya, Rodriguez membagikan contoh bagaimana pengujian genetik berdampak dramatis pada kelangsungan hidup pasien. Dalam satu kasus, seorang gadis berusia 14 tahun mengalami serangan jantung dan ditemukan memiliki kardiomiopati dilatasi onset baru. Apakah etiologi diperoleh atau menular dan mungkin reversibel atau genetik tidak jelas, katanya.
“Hasil genom diagnostik dalam waktu 48 jam menunjukkan etiologi genetik,” katanya. Pasien terdaftar untuk transplantasi jantung meskipun infeksi tidak lengkap, dan menerima transplantasi jantung yang sukses 1 minggu setelah masuk, kata Rodriguez.
Pedoman untuk pasien PICU mana yang harus menjalani tes genetik belum ada, kata Rodriguez kepada Medscape. “Kami sedang mencoba untuk menemukan beberapa parameter yang lebih bermakna di mana kami dapat mengatakan bahwa seorang pasien memiliki kemungkinan pretest tinggi dari kondisi genetik,” katanya.
Namun, “Meningkatnya ketersediaan rWGS dapat berdampak signifikan terhadap perawatan pasien dan membantu keluarga dalam membuat keputusan sulit selama masa penyakit kritis,” katanya.
Cakupan asuransi dan akses pengujian meningkat, kata Rodriguez. Kebijakan Medicaid saat ini ada untuk neonatus/bayi di ICU di beberapa negara bagian, termasuk Oregon, California, Michigan, Maryland, dan Louisiana, katanya. Di beberapa daerah, rumah sakit dapat membayar untuk pengujian anak-anak ini jika asuransi tidak mau, tambahnya.
Rodriguez dan rekan terus mendaftarkan pasien dalam studi prospektif tentang dampak rWGS, dengan penambahan situs studi keempat dan dimasukkannya survei keluarga. “Kami juga akan melihat analisis sekunder penghematan biaya dan manfaat,” katanya.
Pada akhirnya, studi saat ini harus memberdayakan para dokter, “terutama jika mereka tidak memiliki akses yang baik ke ahli genetika,” kata Rodriguez kepada Medscape.
Studi ini tidak menerima dana dari luar. Rodriguez melaporkan tidak ada hubungan keuangan yang relevan.
Society for Critical Care Medicine 2023 Kongres Perawatan Kritis: Abstrak 25 Analisis Kohort Multi-Pusat Pengurutan Genom Cepat di PICU. Disajikan 13 Januari 2023.
Heidi Splete adalah jurnalis medis lepas dengan pengalaman 20 tahun.
Untuk berita lebih lanjut, ikuti Medscape di Facebook, Twitter, Instagram, YouTube, dan LinkedIn