Para penulis makalah yang mengusulkan varian Omicron dari SARS-Cov-2 telah berevolusi di Afrika Barat beberapa bulan sebelum pertama kali terdeteksi di Afrika Selatan telah menarik penelitian mereka setelah menemukan kontaminasi dalam sampel mereka, seperti yang disarankan oleh beberapa ilmuwan di Twitter. kasus.
Artikel, “Kemunculan bertahap diikuti oleh penyebaran eksponensial varian SARS-CoV-2 Omicron di Afrika,” diterbitkan di Science pada 1 Desember oleh tim yang dipimpin oleh Jan Felix Drexler dari Charité – Universitätsmedizin Berlin.
Segera setelah publikasi, banyak ahli genetika menyatakan skeptis di media sosial tentang penelitian tersebut, termasuk mempertanyakan apakah hasil tersebut berasal dari kontaminasi selama proses pengurutan.
Tulio de Oliveira, direktur Center for Epidemic Response and Innovation dan KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform di University of KwaZulu-Natal di Afrika Selatan, men-tweet pada 4 Desember tentang “kelemahan” dalam penelitian tersebut, termasuk bahwa “the kualitas urutan tampaknya bermasalah”:
https://twitter.com/Tuliodna/status/1599366087077875712?ref_src=twsrc%5Etfw%7Ctwcamp%5Etweetembed%7Ctwterm%5E1599366087077875712%7Ctwgr%5Eae8e8b5bebc3c89dc90a6893e7b4201dbb3091f5%7Ctwcon%5Es1_&ref_url=https%3A%2F%2Fretractionwatch.com%2F2022%2F12% 2F20%2Fkontaminasi-menyebabkan-pencabutan-cepat-untuk-kertas-sains-di-asal-omikron-di-afrika%2F
Kritik tersebut mendorong penulis untuk meninjau kembali data mereka. Mereka memang menemukan kontaminasi dan memutuskan untuk mencabut artikel tersebut. Menurut pemberitahuan:
Dalam Artikel Penelitian “Kemunculan bertahap diikuti oleh penyebaran eksponensial varian SARS-CoV-2 Omicron di Afrika” (1), kami melaporkan data dari karakterisasi retrospektif genom virus nenek moyang diduga varian Omicron SARS-CoV-2 dari Barat Afrika berbulan-bulan sebelum deteksi pertama Omicron. Setelah beberapa posting media sosial menyarankan bahwa urutan nenek moyang Omicron awal yang diduga ini mungkin positif palsu, kami menganalisis ulang data kami dan sampel residu. Kami menemukan campuran fragmen genom SARS-CoV-2 yang berbeda yang mencemari beberapa sampel dan data sekuens yang menjadi dasar analisis kami. Sampel sisa sekarang habis, dan rekonstruksi perantara evolusi tidak dapat direplikasi. Oleh karena itu, kami mencabut Artikel Penelitian kami. Data epidemiologi tidak dipertanyakan dan akan tersedia. Semua penulis setuju dengan pencabutan ini. Sebagai pemimpin konsorsium, kami menandatangani Pencabutan ini atas nama semua penulis.
Kami menghubungi penulis terkait Drexler untuk memberikan komentar, dan dia tidak segera menjawab.
Charité – Universitätsmedizin Berlin mengeluarkan siaran pers yang mengatakan:
Salah satu pesan artikel tersebut – bahwa virus dengan rangkaian tanda tangan Omicron sudah ada di seluruh benua sebelum Omicron secara resmi terdeteksi di Afrika Selatan – didasarkan pada data kolektif dari analisis PCR yang dilakukan secara independen oleh laboratorium di beberapa negara Afrika. Namun, rekonstruksi konklusif dari evolusi virus, salah satu pesan utama artikel tersebut, kemungkinan akan dipengaruhi oleh kontaminasi urutan yang tidak terdeteksi sebelum analisis. Kontaminasi juga tidak memungkinkan untuk mengoreksi analisis secara retrospektif pada waktunya, karena hal ini memerlukan analisis tambahan terhadap ribuan sampel pasien dari Afrika yang mungkin tidak tersedia dalam jumlah dan kualitas yang memadai. Oleh karena itu, atas persetujuan semua penulis, seluruh artikel ditarik kembali. Kelompok riset yang menjalankan proyek saat ini sedang melakukan evaluasi dan peninjauan analisis. Kelompok penelitian dan proyek lain di Charite serta yang melibatkan konsorsium penulis tidak terpengaruh. Prof. Drexler dan timnya sangat menyesalkan kejadian tersebut dan berterima kasih kepada rekan-rekan internasional mereka karena menandai potensi masalah setelah publikasi artikel tersebut.
PENGUNGKAPAN: Adam Marcus, salah satu pendiri Retraction Watch, adalah editor di Medscape.